| 1 | 71 | University of Tokyo / 東京大学 |  | 106 | 212 | 50 |
| 2 | 102 | Kyoto University / 京都大学 | | 162 | 143 | 118 |
| 3 | 203 | Osaka University / 大阪大学 | | 350 | 178 | 197 |
| 4 | 227 | Tohoku University / 東北大学 | | 386 | 188 | 218 |
| 5 | 253 | Nagoya University / 名古屋大学 | | 392 | 225 | 250 |
| 6 | 295 | Kyushu University / 九州大学 | | 437 | 377 | 269 |
| 7 | 330 | Tokyo Institute of Technology / 東京工業大学 | | 515 | 291 | 342 |
| 8 | 319 | Hokkaido University / 北海道大学 | | 400 | 329 | 355 |
| 9 | 351 | University of Tsukuba / 筑波大学 | | 432 | 452 | 396 |
| 10 | 357 | Keio University / 慶応義塾大学 | | 233 | 687 | 477 |
| 11 | 467 | Kobe University / 神戸大学 | | 622 | 563 | 537 |
| 12 | 501 | Waseda University / 早稲田大学 | | 611 | 584 | 583 |
| 13 | 482 | Hiroshima University / 広島大学 | | 568 | 534 | 593 |
| 14 | 650 | Okayama University / 岡山大学 | | 1170 | 672 | 615 |
| 15 | 1828 | Chiba University / 千葉大学 | | 1425 | 6492 | 625 |
| 16 | 844 | Shinshu University / 信州大学 | | 1668 | 1045 | 774 |
| 17 | 959 | Tokyo Medical and Dental University / 東京医科歯科大学 | | 2280 | 1072 | 847 |
| 18 | 957 | Tokyo Metropolitan University / 首都大学東京 | | 2333 | 997 | 855 |
| 19 | 855 | Kanazawa University / 金沢大学 | | 1413 | 1049 | 870 |
| 20 | 884 | Kumamoto University / 熊本大学 | | 1539 | 1021 | 899 |
| 21 | 1097 | Yokohama City University / 横浜市立大学 | | 1912 | 2045 | 928 |
| 22 | 904 | Tokyo University of Science / 東京理科大学 | | 1423 | 1070 | 972 |
| 23 | 2200 | The Graduate University for Advanced Studies / 総合研究大学院大学 | | 5680 | 5204 | 987 |
| 24 | 1132 | Juntendo University / 順天堂大学 | | 2856 | 1142 | 1017 |
| 25 | 926 | Kindai University (Kinki University) / 近畿大学 | | 1747 | 809 | 1019 |
| 26 | 998 | Niigata University / 新潟大学 | | 1735 | 1199 | 1026 |
| 27 | 1000 | Nagasaki University / 長崎大学 | | 1547 | 1364 | 1036 |
| 28 | 899 | Nihon University / 日本大学 | | 1113 | 1084 | 1097 |
| 29 | 1073 | Osaka City University / 大阪市立大学 | | 1665 | 1377 | 1139 |
| 30 | 1516 | Jichi Medical School / 自治医科大学 | | 3678 | 2487 | 1166 |
| 31 | 1302 | Tokai University / 東海大学 | | 1603 | 2914 | 1211 |
| 32 | 1183 | Kagoshima University / 鹿児島大学 | | 1835 | 1732 | 1218 |
| 33 | 1082 | Tokyo University of Agriculture and Technology / 東京農工大学 | | 1967 | 953 | 1226 |
| 34 | 1105 | Nara Institute of Science & Technology / 奈良先端科学技術大学院大学 | | 1911 | 1066 | 1233 |
| 35 | 3495 | Nagasaki Institute of Applied Science / 長崎総合科学大学 | | 9137 | 6492 | 1237 |
| 36 | 1189 | University of Tokushima / 徳島大学 | | 2145 | 1413 | 1255 |
| 37 | 1433 | Tokyo Women's Medical University / 東京女子医科大学 | | 3051 | 2167 | 1264 |
| 38 | 1732 | Kyoto Prefectural University of Medicine / 京都府立医科大学 | | 4603 | 2937 | 1264 |
| 39 | 1145 | Gifu University / 岐阜大学 | | 1917 | 1280 | 1281 |
| 40 | 1224 | University of Toyama / 富山大学 | | 2198 | 1505 | 1285 |
| 41 | 1158 | Shizuoka University / 静岡大学 | | 2115 | 1178 | 1285 |
| 42 | 863 | Ritsumeikan University / 立命館大学 | | 664 | 1164 | 1290 |
| 43 | 1604 | Teikyo University / 帝京大学 | | 3270 | 2942 | 1311 |
| 44 | 1165 | Ehime University / 愛媛大学 | | 1889 | 1335 | 1320 |
| 45 | 1598 | Nippon Medical School / 日本医科大学 | | 3873 | 2274 | 1351 |
| 46 | 1442 | Kitasato University / 北里大学 | | 2623 | 2308 | 1351 |
| 47 | 1148 | Osaka Prefecture University / 大阪府立大学 | | 2009 | 1003 | 1375 |
| 48 | 1531 | Toho University / 東邦大学 | | 2041 | 3441 | 1377 |
| 49 | 1151 | Yamagata University / 山形大学 | | 1374 | 1674 | 1378 |
| 50 | 1778 | Jikei University School of Medicine / 東京慈恵会医科大学 | | 4371 | 2957 | 1391 |
| 51 | 3002 | Hiroshima Institute of Technology / 広島工業大学 | | 4479 | 6492 | 1392 |
| 52 | 3215 | Kyoto University of Education / 京都教育大学 | | 5685 | 6492 | 1422 |
| 53 | 1179 | Gunma University / 群馬大学 | | 1768 | 1276 | 1436 |
| 54 | 1965 | Tokyo Medical University / 東京医科大学 | | 3560 | 4412 | 1440 |
| 55 | 1563 | Fujita Health University / 藤田保健衛生大学 | | 3545 | 1928 | 1466 |
| 56 | 1143 | University of Electro-Communications / 電気通信大学 | | 1448 | 1273 | 1472 |
| 57 | 1219 | Mie University / 三重大学 | | 1631 | 1535 | 1472 |
| 58 | 2540 | Saitama Medical University / 埼玉医科大学 | | 5149 | 5426 | 1472 |
| 59 | 1226 | Okinawa Institute of Science & Technology Graduate University / 沖縄科学技術大学院大学 | | 2215 | 979 | 1499 |
| 60 | 1158 | Yokohama National University / 横浜国立大学 | | 1777 | 942 | 1512 |
| 61 | 1397 | University of Yamanashi / 山梨大学 | | 2654 | 1559 | 1522 |
| 62 | 1513 | Nagoya City University / 名古屋市立大学 | | 3285 | 1686 | 1530 |
| 63 | 1717 | Showa University / 昭和大学 | | 3783 | 2604 | 1551 |
| 64 | 1522 | Saga University / 佐賀大学 | | 2593 | 2240 | 1555 |
| 65 | 1353 | Kyushu Institute of Technology / 九州工業大学 | | 2030 | 1748 | 1560 |
| 66 | 1647 | Kagawa University / 香川大学 | | 2894 | 2752 | 1574 |
| 67 | 1399 | Yamaguchi University / 山口大学 | | 1839 | 2228 | 1581 |
| 68 | 3303 | Hyogo College of Medicine / 兵庫医科大学 | | 5646 | 6492 | 1592 |
| 69 | 1716 | Ochanomizu University / お茶の水女子大学 | | 2702 | 3320 | 1598 |
| 70 | 2193 | Kurume University / 久留米大学 | | 4572 | 4330 | 1611 |
| 71 | 1586 | Fukuoka University / 福岡大学 | | 2302 | 2699 | 1640 |
| 72 | 1930 | Fukushima Medical University / 福島県立医科大学 | | 4468 | 2921 | 1657 |
| 73 | 3334 | University of Occupational & Environmental Health Japan / 産業医科大学 | | 5472 | 6492 | 1668 |
| 74 | 1568 | Shimane University / 島根大学 | | 2816 | 1955 | 1672 |
| 75 | 1455 | Tottori University / 鳥取大学 | | 2156 | 1835 | 1693 |
| 76 | 2963 | Wakayama Medical College / 和歌山県立医科大学 | | 6130 | 5836 | 1696 |
| 77 | 1442 | Saitama University / 埼玉大学 | | 2173 | 1736 | 1699 |
| 78 | 1411 | Nagoya Institute of Technology / 名古屋工業大学 | | 2269 | 1483 | 1717 |
| 79 | 1638 | Hirosaki University / 弘前大学 | | 2544 | 2568 | 1717 |
| 80 | 1366 | University of Ryukyus / 琉球大学 | | 1776 | 1669 | 1722 |
| 81 | 1631 | Kochi University / 高知大学 | | 2774 | 2219 | 1737 |
| 82 | 2560 | Toyota Technological Institute / 豊田工業大学 | | 9329 | 3074 | 1772 |
| 83 | 1850 | Hamamatsu University School of Medicine / 浜松医科大学 | | 4724 | 1879 | 1785 |
| 84 | 1682 | University of Miyazaki / 宮崎大学 | | 2889 | 2227 | 1836 |
| 85 | 2897 | Nara Medical University / 奈良県立医科大学 | | 4955 | 5857 | 1862 |
| 86 | 2991 | Aichi Medical University / 愛知医科大学 | | 6256 | 5619 | 1877 |
| 87 | 2174 | Sapporo Medical University / 札幌医科大学 | | 3765 | 4128 | 1890 |
| 88 | 2648 | Shiga University of Medical Science / 滋賀医科大学 | | 4635 | 5317 | 1890 |
| 89 | 3583 | Iwate Medical University / 岩手医科大学 | | 6072 | 6492 | 1916 |
| 90 | 3183 | Kyorin University / 杏林大学 | | 3593 | 6492 | 1923 |
| 91 | 1258 | Japan Advanced Institute of Science & Technology / 北陸先端科学技術大学院大学 | | 1053 | 1490 | 1942 |
| 92 | 1641 | University of Aizu / 会津大学 | | 2591 | 1926 | 1955 |
| 93 | 2751 | St Marianna University School of Medicine / 聖マリアンナ医科大学 | | 5313 | 5144 | 1995 |
| 94 | 2224 | Kawasaki University of Medical Welfare Kawasaki Medical School / 川崎医科大学 | | 4945 | 3109 | 2053 |
| 95 | 2080 | Oita University / 大分大学 | | 3552 | 3416 | 2064 |
| 96 | 1387 | Meiji University / 明治大学 | | 1095 | 1983 | 2066 |
| 97 | 1874 | University of Hyogo (Himeji Institute of Technology) / 兵庫県立大学 | | 4046 | 1780 | 2087 |
| 98 | 1601 | Rikkyo University / 立教大学 | | 1587 | 2413 | 2101 |
| 99 | 2332 | Kansai Medical University / 関西医科大学 | | 5117 | 3382 | 2119 |
| 100 | 1895 | University of Fukui / 福井大学 | | 3593 | 2146 | 2128 |
