| 1 | 67 | University of Tokyo / 東京大学 |  | 43 | 105 | 265 | 45 |
| 2 | 103 | Kyoto University / 京都大学 | | 63 | 166 | 161 | 97 |
| 3 | 194 | Osaka University / 大阪大学 | | 220 | 346 | 173 | 163 |
| 4 | 237 | Tohoku University / 東北大学 | | 385 | 424 | 201 | 181 |
| 5 | 267 | Nagoya University / 名古屋大学 | | 599 | 415 | 222 | 231 |
| 6 | 314 | Kyushu University / 九州大学 | | 490 | 464 | 405 | 260 |
| 7 | 314 | Hokkaido University / 北海道大学 | | 328 | 400 | 322 | 327 |
| 8 | 322 | Keio University / 慶応義塾大学 | | 145 | 237 | 668 | 440 |
| 9 | 346 | Tokyo Institute of Technology / 東京工業大学 | | 522 | 516 | 297 | 305 |
| 10 | 357 | University of Tsukuba / 筑波大学 | | 429 | 433 | 463 | 371 |
| 11 | 473 | Hiroshima University / 広島大学 | | 263 | 584 | 580 | 545 |
| 12 | 475 | Kobe University / 神戸大学 | | 614 | 670 | 552 | 491 |
| 13 | 479 | Waseda University / 早稲田大学 | | 548 | 616 | 543 | 532 |
| 14 | 683 | Okayama University / 岡山大学 | | 656 | 1317 | 701 | 586 |
| 15 | 756 | Ritsumeikan University / 立命館大学 | | 836 | 640 | 1140 | 1045 |
| 16 | 844 | Kanazawa University / 金沢大学 | | 1358 | 1525 | 1001 | 796 |
| 17 | 850 | Tokyo University of Science / 東京理科大学 | | 2121 | 1292 | 983 | 865 |
| 18 | 853 | Shinshu University / 信州大学 | | 1391 | 1740 | 1072 | 713 |
| 19 | 871 | Kumamoto University / 熊本大学 | | 1269 | 1522 | 1191 | 831 |
| 20 | 874 | Nihon University / 日本大学 | | 784 | 1135 | 1253 | 996 |
| 21 | 915 | Niigata University / 新潟大学 | | 1060 | 1706 | 1048 | 905 |
| 22 | 941 | Chiba University / 千葉大学 | | 2554 | 1411 | 4624 | 567 |
| 23 | 948 | Nagasaki University / 長崎大学 | | 1234 | 1638 | 1134 | 964 |
| 24 | 953 | Kindai University (Kinki University) / 近畿大学 | | 1518 | 1944 | 767 | 932 |
| 25 | 995 | Tokyo Medical and Dental University / 東京医科歯科大学 | | 2179 | 2594 | 1078 | 773 |
| 26 | 1026 | Tokyo Metropolitan University / 首都大学東京 | | 2745 | 2567 | 967 | 817 |
| 27 | 1035 | Yamagata University / 山形大学 | | 1555 | 1355 | 1532 | 1193 |
| 28 | 1062 | Osaka City University / 大阪市立大学 | | 1269 | 1958 | 1413 | 1007 |
| 29 | 1095 | Tokyo University of Agriculture and Technology / 東京農工大学 | | 2317 | 2143 | 912 | 1068 |
| 30 | 1113 | Gifu University / 岐阜大学 | | 1289 | 2029 | 1166 | 1139 |
| 31 | 1136 | Gunma University / 群馬大学 | | 1449 | 1765 | 1387 | 1248 |
| 32 | 1148 | Nara Institute of Science & Technology / 奈良先端科学技術大学院大学 | | 1305 | 2284 | 882 | 1199 |
| 33 | 1150 | Kagoshima University / 鹿児島大学 | | 1128 | 1916 | 1757 | 1133 |
| 34 | 1155 | University of Tokushima / 徳島大学 | | 1475 | 2351 | 1200 | 1080 |
| 35 | 1158 | Mie University / 三重大学 | | 1539 | 1770 | 1372 | 1273 |
| 36 | 1169 | Tokai University / 東海大学 | | 1456 | 1596 | 3175 | 1063 |
| 37 | 1175 | Osaka Prefecture University / 大阪府立大学 | | 1785 | 2379 | 970 | 1178 |
| 38 | 1179 | University of Electro-Communications / 電気通信大学 | | 2027 | 1550 | 1175 | 1477 |
| 39 | 1179 | Shizuoka University / 静岡大学 | | 1622 | 2279 | 1059 | 1216 |
| 40 | 1207 | University of Toyama / 富山大学 | | 1989 | 2145 | 1327 | 1228 |
| 41 | 1210 | United Nations University (国際連合大学) | | 1565 | 329 | 1524 | 2804 |
| 42 | 1230 | Yokohama National University / 横浜国立大学 | | 1764 | 1939 | 880 | 1485 |
| 43 | 1233 | Japan Advanced Institute of Science & Technology / 北陸先端科学技術大学院大学 | | 1863 | 1156 | 1326 | 1793 |
| 44 | 1236 | Yamaguchi University / 山口大学 | | 1242 | 1806 | 2188 | 1288 |
| 45 | 1263 | Juntendo University / 順天堂大学 | | 2721 | 3388 | 1211 | 955 |
| 46 | 1265 | Yokohama City University / 横浜市立大学 | | 2375 | 3227 | 2024 | 894 |
| 47 | 1295 | Kyushu Institute of Technology / 九州工業大学 | | 2262 | 2002 | 1434 | 1441 |
| 48 | 1323 | Meiji University / 明治大学 | | 1104 | 1147 | 1941 | 1945 |
| 49 | 1369 | Doshisha University / 同志社大学 | | 953 | 1482 | 1845 | 1886 |
| 50 | 1380 | Tokyo Women's Medical University / 東京女子医科大学 | | 4515 | 3038 | 2176 | 1043 |
| 51 | 1383 | Nagoya Institute of Technology / 名古屋工業大学 | | 2442 | 2381 | 1473 | 1482 |
| 52 | 1389 | Fukuoka University / 福岡大学 | | 1001 | 2185 | 2254 | 1477 |
| 53 | 1392 | Saga University / 佐賀大学 | | 1749 | 2596 | 1856 | 1366 |
| 54 | 1402 | University of Ryukyus / 琉球大学 | | 920 | 2141 | 1664 | 1643 |
| 55 | 1406 | University of Yamanashi / 山梨大学 | | 2314 | 2879 | 1642 | 1325 |
| 56 | 1409 | Toho University / 東邦大学 | | 3117 | 2353 | 2969 | 1246 |
| 57 | 1416 | Kitasato University / 北里大学 | | 2574 | 2883 | 2199 | 1225 |
| 58 | 1440 | Saitama University / 埼玉大学 | | 2642 | 2259 | 1633 | 1567 |
| 59 | 1492 | Hosei University / 法政大学 | | 857 | 1472 | 2210 | 2080 |
| 60 | 1494 | Okinawa Institute of Science & Technology Graduate University / 沖縄科学技術大学院大学 | | 3377 | 2805 | 949 | 1643 |
| 61 | 1534 | Shimane University / 島根大学 | | 1223 | 2625 | 1869 | 1652 |
| 62 | 1540 | Nagoya City University / 名古屋市立大学 | | 3580 | 3338 | 1525 | 1392 |
| 63 | 1544 | Tottori University / 鳥取大学 | | 1622 | 3094 | 1606 | 1541 |
| 64 | 1556 | Ochanomizu University / お茶の水女子大学 | | 964 | 2942 | 3026 | 1411 |
| 65 | 1573 | University of Miyazaki / 宮崎大学 | | 2532 | 2355 | 2434 | 1668 |
| 66 | 1580 | Hirosaki University / 弘前大学 | | 2822 | 2687 | 2515 | 1532 |
| 67 | 1584 | Jichi Medical School / 自治医科大学 | | 3576 | 4172 | 2055 | 1106 |
| 68 | 1589 | Kochi University / 高知大学 | | 2822 | 3029 | 2450 | 1435 |
| 69 | 1600 | Kansai University / 関西大学 | | 1403 | 1893 | 1969 | 2082 |
| 70 | 1610 | Kagawa University / 香川大学 | | 1785 | 3096 | 2730 | 1462 |
| 71 | 1617 | Teikyo University / 帝京大学 | | 4049 | 3514 | 3321 | 1149 |
| 72 | 1620 | Chuo University / 中央大学 | | 1684 | 1843 | 2129 | 2118 |
| 73 | 1635 | Nippon Medical School / 日本医科大学 | | 6149 | 3776 | 2036 | 1270 |
| 74 | 1668 | Nagaoka University of Technology / 長岡技術科学大学 | | 2413 | 2274 | 2381 | 1931 |
| 75 | 1670 | Rikkyo University / 立教大学 | | 1797 | 2312 | 2662 | 1894 |
| 76 | 1679 | Sophia University / 上智大学 | | 2099 | 1696 | 2219 | 2275 |
| 77 | 1687 | University of Aizu / 会津大学 | | 3225 | 2918 | 1732 | 1808 |
| 78 | 1730 | Fujita Health University / 藤田保健衛生大学 | | 4449 | 4207 | 1714 | 1429 |
| 79 | 1754 | Showa University / 昭和大学 | | 4746 | 3892 | 2596 | 1419 |
| 80 | 1765 | Kwansei Gakuin University / 関西学院大学 | | 1277 | 2549 | 1953 | 2210 |
| 81 | 1782 | Akita University / 秋田大学 | | 2655 | 3283 | 1745 | 1931 |
| 82 | 1784 | Toyohashi University of Technology / 豊橋科学技術大学 | | 3302 | 2563 | 2607 | 2009 |
| 83 | 1795 | Jikei University School of Medicine / 東京慈恵会医科大学 | | 4500 | 4460 | 2884 | 1273 |
| 84 | 1802 | Tokyo Medical University / 東京医科大学 | | 5163 | 3736 | 4305 | 1248 |
| 85 | 1803 | Kyoto Prefectural University of Medicine / 京都府立医科大学 | | 5124 | 4678 | 3147 | 1162 |
| 86 | 1820 | Aoyama Gakuin University / 青山学院大学 | | 2757 | 2422 | 2505 | 2202 |
| 87 | 1859 | University of Fukui / 福井大学 | | 2948 | 3940 | 1982 | 1790 |
| 88 | 1864 | Kyoto Institute of Technology / 京都工芸繊維大学 | | 3074 | 3331 | 2314 | 1962 |
| 89 | 1868 | Ibaraki University / 茨城大学 | | 2148 | 3168 | 2123 | 2105 |
| 90 | 1879 | University of Hyogo (Himeji Institute of Technology) / 兵庫県立大学 | | 3153 | 4153 | 1768 | 1797 |
| 91 | 1940 | Chubu University / 中部大学 | | 2943 | 3607 | 2146 | 2065 |
| 92 | 1947 | Kurume University / 久留米大学 | | 4508 | 4356 | 3653 | 1453 |
| 93 | 1947 | Fukushima Medical University / 福島県立医科大学 | | 3491 | 4454 | 3120 | 1549 |
| 94 | 1954 | Hamamatsu University School of Medicine / 浜松医科大学 | | 7124 | 4747 | 1772 | 1637 |
| 95 | 1964 | Hitotsubashi University / 一橋大学 | | 1060 | 1733 | 2801 | 2900 |
| 96 | 1965 | The Graduate University for Advanced Studies / 総合研究大学院大学 | | 4605 | 5782 | 4397 | 980 |
| 97 | 1970 | Iwate University / 岩手大学 | | 2589 | 2736 | 3581 | 2163 |
| 98 | 2015 | Shibaura Institute of Technology / 芝浦工業大学 | | 3251 | 3448 | 1593 | 2375 |
| 99 | 2028 | Oita University / 大分大学 | | 3294 | 3687 | 3320 | 1938 |
| 100 | 2048 | Kyoto Sangyo University / 京都産業大学 | | 2517 | 2693 | 3089 | 2438 |
