| 1 | 65 | University of Tokyo / 東京大学 |  | 101 | 220 | 43 |
| 2 | 97 | Kyoto University / 京都大学 | | 144 | 139 | 123 |
| 3 | 193 | Osaka University / 大阪大学 | | 287 | 174 | 214 |
| 4 | 220 | Tohoku University / 東北大学 | | 330 | 183 | 222 |
| 5 | 268 | Nagoya University / 名古屋大学 | | 395 | 230 | 266 |
| 6 | 306 | Hokkaido University / 北海道大学 | | 327 | 333 | 374 |
| 7 | 313 | Kyushu University / 九州大学 | | 446 | 360 | 290 |
| 8 | 337 | University of Tsukuba / 筑波大学 | | 372 | 451 | 400 |
| 9 | 341 | Keio University / 慶応義塾大学 | | 226 | 697 | 478 |
| 10 | 354 | Tokyo Institute of Technology / 東京工業大学 | | 507 | 297 | 355 |
| 11 | 443 | Waseda University / 早稲田大学 | | 439 | 571 | 597 |
| 12 | 480 | Hiroshima University / 広島大学 | | 537 | 541 | 596 |
| 13 | 485 | Kobe University / 神戸大学 | | 622 | 566 | 567 |
| 14 | 683 | Okayama University / 岡山大学 | | 1177 | 659 | 644 |
| 15 | 823 | Kanazawa University / 金沢大学 | | 1133 | 1039 | 909 |
| 16 | 842 | Kumamoto University / 熊本大学 | | 1155 | 1038 | 940 |
| 17 | 866 | Shinshu University / 信州大学 | | 1464 | 1095 | 836 |
| 18 | 875 | Nihon University / 日本大学 | | 911 | 1131 | 1160 |
| 19 | 875 | Ritsumeikan University / 立命館大学 | | 650 | 1154 | 1410 |
| 20 | 893 | Yokohama City University / 横浜市立大学 | | 1027 | 2047 | 962 |
| 21 | 935 | Juntendo University / 順天堂大学 | | 1320 | 1096 | 1077 |
| 22 | 969 | Tokyo Medical and Dental University / 東京医科歯科大学 | | 1883 | 1046 | 903 |
| 23 | 971 | Niigata University / 新潟大学 | | 1252 | 1186 | 1153 |
| 24 | 976 | Tokyo Metropolitan University / 首都大学東京 | | 1946 | 1052 | 894 |
| 25 | 976 | Tokyo University of Science / 東京理科大学 | | 1478 | 1091 | 1068 |
| 26 | 982 | Kindai University (Kinki University) / 近畿大学 | | 1654 | 798 | 1090 |
| 27 | 1012 | Osaka City University / 大阪市立大学 | | 1188 | 1458 | 1224 |
| 28 | 1023 | Nagasaki University / 長崎大学 | | 1488 | 1401 | 1113 |
| 29 | 1115 | Nara Institute of Science & Technology / 奈良先端科学技術大学院大学 | | 1716 | 1086 | 1272 |
| 30 | 1142 | Gifu University / 岐阜大学 | | 1561 | 1332 | 1345 |
| 31 | 1144 | Japan Advanced Institute of Science & Technology / 北陸先端科学技術大学院大学 | | 667 | 1515 | 2036 |
| 32 | 1157 | Tokai University / 東海大学 | | 1240 | 3076 | 1239 |
| 33 | 1157 | Osaka Prefecture University / 大阪府立大学 | | 1375 | 1034 | 1557 |
| 34 | 1161 | Mie University / 三重大学 | | 1100 | 1576 | 1609 |
| 35 | 1162 | Tottori University / 鳥取大学 | | 841 | 1974 | 1791 |
| 36 | 1165 | Ehime University / 愛媛大学 | | 1518 | 1370 | 1411 |
| 37 | 1186 | Yamagata University / 山形大学 | | 1187 | 1735 | 1553 |
| 38 | 1202 | Kagoshima University / 鹿児島大学 | | 1575 | 1770 | 1370 |
| 39 | 1203 | Tokyo University of Agriculture and Technology / 東京農工大学 | | 2104 | 933 | 1345 |
| 40 | 1217 | Yokohama National University / 横浜国立大学 | | 1424 | 974 | 1655 |
| 41 | 1221 | University of Tokushima / 徳島大学 | | 1959 | 1433 | 1294 |
| 42 | 1233 | United Nations University / 国際連合大学 | | 315 | 1831 | 2873 |
| 43 | 1242 | University of Electro-Communications / 電気通信大学 | | 1510 | 1319 | 1565 |
| 44 | 1270 | University of Toyama / 富山大学 | | 2069 | 1552 | 1361 |
| 45 | 1273 | Okinawa Institute of Science & Technology Graduate University / 沖縄科学技術大学院大学 | | 2173 | 935 | 1494 |
| 46 | 1274 | Yamaguchi University / 山口大学 | | 1227 | 2330 | 1631 |
| 47 | 1280 | Gunma University / 群馬大学 | | 1821 | 1289 | 1544 |
| 48 | 1328 | Kitasato University / 北里大学 | | 1806 | 2273 | 1492 |
| 49 | 1351 | Hirosaki University / 弘前大学 | | 1418 | 2386 | 1722 |
| 50 | 1362 | Jichi Medical School / 自治医科大学 | | 2446 | 2376 | 1264 |
| 51 | 1366 | The Graduate University for Advanced Studies / 総合研究大学院大学 | | 1802 | 5663 | 976 |
| 52 | 1371 | Chiba University / 千葉大学 | | 1201 | 7420 | 695 |
| 53 | 1406 | Toho University / 東邦大学 | | 1847 | 3470 | 1437 |
| 54 | 1424 | University of Yamanashi / 山梨大学 | | 2185 | 1608 | 1631 |
| 55 | 1441 | Tokyo Women's Medical University / 東京女子医科大学 | | 2886 | 2056 | 1336 |
| 56 | 1445 | Kyushu Institute of Technology / 九州工業大学 | | 2159 | 1810 | 1642 |
| 57 | 1459 | Fujita Health University / 藤田保健衛生大学 | | 2482 | 1860 | 1537 |
| 58 | 1467 | University of Ryukyus / 琉球大学 | | 1983 | 1668 | 1811 |
| 59 | 1471 | Meiji University / 明治大学 | | 1041 | 2108 | 2358 |
| 60 | 1471 | Rikkyo University / 立教大学 | | 1099 | 2630 | 2180 |
| 61 | 1475 | Teikyo University / 帝京大学 | | 2289 | 3021 | 1448 |
| 62 | 1492 | Nagoya Institute of Technology / 名古屋工業大学 | | 2184 | 1478 | 1811 |
| 63 | 1508 | Nagoya City University / 名古屋市立大学 | | 2509 | 1708 | 1636 |
| 64 | 1531 | Hosei University / 法政大学 | | 1084 | 2225 | 2429 |
| 65 | 1557 | Kochi University / 高知大学 | | 1643 | 2377 | 2006 |
| 66 | 1570 | Jikei University School of Medicine / 東京慈恵会医科大学 | | 2505 | 3255 | 1504 |
| 67 | 1574 | Saga University / 佐賀大学 | | 2078 | 2284 | 1856 |
| 68 | 1574 | Showa University / 昭和大学 | | 2407 | 2531 | 1653 |
| 69 | 1584 | Tokyo Medical University / 東京医科大学 | | 2441 | 4037 | 1408 |
| 70 | 1596 | Doshisha University / 同志社大学 | | 1132 | 2236 | 2549 |
| 71 | 1603 | Kwansei Gakuin University / 関西学院大学 | | 1536 | 1928 | 2268 |
| 72 | 1612 | Fukuoka University / 福岡大学 | | 2432 | 2645 | 1693 |
| 73 | 1612 | Saitama University / 埼玉大学 | | 2471 | 1844 | 1847 |
| 74 | 1648 | Kyoto Prefectural University of Medicine / 京都府立医科大学 | | 3536 | 2674 | 1406 |
| 75 | 1679 | Nippon Medical School / 日本医科大学 | | 3736 | 2437 | 1453 |
| 76 | 1689 | Shimane University / 島根大学 | | 3044 | 1771 | 1794 |
| 77 | 1696 | University of Miyazaki / 宮崎大学 | | 2472 | 2267 | 1915 |
| 78 | 1698 | Ochanomizu University / お茶の水女子大学 | | 2380 | 3526 | 1724 |
| 79 | 1702 | Kagawa University / 香川大学 | | 2744 | 2584 | 1774 |
| 80 | 1716 | Chuo University / 中央大学 | | 1660 | 1732 | 2539 |
| 81 | 1742 | Kansai University / 関西大学 | | 1360 | 1855 | 2771 |
| 82 | 1790 | University of Aizu / 会津大学 | | 2515 | 2196 | 2142 |
| 83 | 1819 | Sophia University / 上智大学 | | 1637 | 2631 | 2608 |
| 84 | 1827 | University of Fukui / 福井大学 | | 2134 | 2254 | 2404 |
| 85 | 1872 | Nagaoka University of Technology / 長岡技術科学大学 | | 2255 | 2788 | 2336 |
| 86 | 1893 | University of Shizuoka / 静岡県立大学 | | 4439 | 3644 | 1485 |
| 87 | 1934 | Shibaura Institute of Technology / 芝浦工業大学 | | 2579 | 1836 | 2539 |
| 88 | 1956 | Toyohashi University of Technology / 豊橋科学技術大学 | | 2371 | 2804 | 2448 |
| 89 | 2014 | Fukushima Medical University / 福島県立医科大学 | | 4773 | 2871 | 1702 |
| 90 | 2028 | Aoyama Gakuin University / 青山学院大学 | | 2063 | 2808 | 2740 |
| 91 | 2032 | Chubu University / 中部大学 | | 2533 | 3027 | 2493 |
| 92 | 2037 | Kyoto Institute of Technology / 京都工芸繊維大学 | | 2543 | 2208 | 2669 |
| 93 | 2043 | Iwate University / 岩手大学 | | 1780 | 4198 | 2622 |
| 94 | 2050 | Hamamatsu University School of Medicine / 浜松医科大学 | | 5013 | 1925 | 1893 |
| 95 | 2063 | Akita University / 秋田大学 | | 3020 | 3228 | 2277 |
| 96 | 2068 | Ibaraki University / 茨城大学 | | 2833 | 2304 | 2587 |
| 97 | 2076 | Oita University / 大分大学 | | 2862 | 3622 | 2287 |
| 98 | 2118 | University of Hyogo (Himeji Institute of Technology) / 兵庫県立大学 | | 3800 | 1834 | 2469 |
| 99 | 2121 | Sapporo Medical University / 札幌医科大学 | | 3303 | 4063 | 2127 |
| 100 | 2161 | Kurume University / 久留米大学 | | 4702 | 3965 | 1799 |
