| 1 | 65 | University of Tokyo / 東京大学 |  | 66 | 106 | 248 | 48 |
| 2 | 97 | Kyoto University / 京都大学 | | 50 | 163 | 155 | 98 |
| 3 | 200 | Osaka University / 大阪大学 | | 223 | 359 | 184 | 167 |
| 4 | 235 | Tohoku University / 東北大学 | | 298 | 417 | 193 | 196 |
| 5 | 267 | Nagoya University / 名古屋大学 | | 531 | 416 | 247 | 232 |
| 6 | 310 | Kyushu University / 九州大学 | | 508 | 468 | 375 | 265 |
| 7 | 315 | Hokkaido University / 北海道大学 | | 397 | 404 | 317 | 339 |
| 8 | 328 | Keio University / 慶応義塾大学 | | 281 | 228 | 677 | 450 |
| 9 | 342 | Tokyo Institute of Technology / 東京工業大学 | | 533 | 524 | 300 | 309 |
| 10 | 347 | University of Tsukuba / 筑波大学 | | 440 | 431 | 447 | 374 |
| 11 | 470 | Hiroshima University / 広島大学 | | 380 | 589 | 544 | 559 |
| 12 | 475 | Waseda University / 早稲田大学 | | 478 | 604 | 578 | 546 |
| 13 | 479 | Kobe University / 神戸大学 | | 698 | 653 | 583 | 507 |
| 14 | 683 | Okayama University / 岡山大学 | | 615 | 1284 | 737 | 602 |
| 15 | 766 | Ritsumeikan University / 立命館大学 | | 495 | 650 | 1206 | 1114 |
| 16 | 847 | Shinshu University / 信州大学 | | 1489 | 1683 | 1148 | 739 |
| 17 | 850 | Tokyo University of Science / 東京理科大学 | | 2179 | 1246 | 1092 | 899 |
| 18 | 856 | Kanazawa University / 金沢大学 | | 1391 | 1517 | 1088 | 820 |
| 19 | 874 | Nihon University / 日本大学 | | 678 | 1128 | 1210 | 1031 |
| 20 | 906 | Kumamoto University / 熊本大学 | | 1478 | 1611 | 1323 | 865 |
| 21 | 933 | Niigata University / 新潟大学 | | 1098 | 1710 | 1197 | 928 |
| 22 | 935 | Nagasaki University / 長崎大学 | | 1147 | 1607 | 1274 | 964 |
| 23 | 955 | Kindai University (Kinki University) / 近畿大学 | | 2070 | 1892 | 795 | 983 |
| 24 | 989 | Tokyo Medical and Dental University / 東京医科歯科大学 | | 1926 | 2396 | 1245 | 801 |
| 25 | 1012 | Tokyo Metropolitan University / 首都大学東京 | | 2974 | 2487 | 1025 | 827 |
| 26 | 1073 | Yamagata University / 山形大学 | | 1593 | 1318 | 1672 | 1275 |
| 27 | 1078 | Osaka City University / 大阪市立大学 | | 1169 | 1924 | 1517 | 1054 |
| 28 | 1108 | Tokyo University of Agriculture and Technology / 東京農工大学 | | 2680 | 2103 | 981 | 1121 |
| 29 | 1132 | Nara Institute of Science & Technology / 奈良先端科学技術大学院大学 | | 1836 | 2113 | 973 | 1213 |
| 30 | 1134 | United Nations University (国際連合大学) | | 29 | 315 | 1667 | 3036 |
| 31 | 1139 | Gifu University / 岐阜大学 | | 1169 | 2063 | 1261 | 1193 |
| 32 | 1154 | Gunma University / 群馬大学 | | 1817 | 1761 | 1452 | 1288 |
| 33 | 1159 | University of Electro-Communications / 電気通信大学 | | 1661 | 1528 | 1252 | 1475 |
| 34 | 1168 | Kagoshima University / 鹿児島大学 | | 1263 | 1909 | 1770 | 1171 |
| 35 | 1178 | Shizuoka University / 静岡大学 | | 1736 | 2233 | 1186 | 1209 |
| 36 | 1184 | University of Tokushima / 徳島大学 | | 1569 | 2282 | 1369 | 1155 |
| 37 | 1190 | Mie University / 三重大学 | | 1514 | 1736 | 1520 | 1366 |
| 38 | 1211 | Osaka Prefecture University / 大阪府立大学 | | 1803 | 2368 | 1050 | 1254 |
| 39 | 1222 | Yokohama National University / 横浜国立大学 | | 2273 | 1886 | 944 | 1492 |
| 40 | 1227 | University of Toyama / 富山大学 | | 1842 | 2130 | 1498 | 1260 |
| 41 | 1228 | Yokohama City University / 横浜市立大学 | | 3732 | 2630 | 2275 | 892 |
| 42 | 1243 | Japan Advanced Institute of Science & Technology / 北陸先端科学技術大学院大学 | | 1966 | 1120 | 1478 | 1862 |
| 43 | 1250 | Juntendo University / 順天堂大学 | | 2700 | 3197 | 1315 | 990 |
| 44 | 1286 | Yamaguchi University / 山口大学 | | 1090 | 1852 | 2237 | 1400 |
| 45 | 1304 | Tokai University / 東海大学 | | 2159 | 1597 | 4070 | 1085 |
| 46 | 1306 | Kyushu Institute of Technology / 九州工業大学 | | 2415 | 2022 | 1618 | 1475 |
| 47 | 1321 | Meiji University / 明治大学 | | 1190 | 1129 | 1986 | 2022 |
| 48 | 1330 | Saitama University / 埼玉大学 | | 97 | 2293 | 1710 | 1595 |
| 49 | 1339 | Chiba University / 千葉大学 | | 2194 | 1401 | 5819 | 598 |
| 50 | 1351 | Okinawa Institute of Science & Technology Graduate University / 沖縄科学技術大学院大学 | | 1912 | 2592 | 1036 | 1525 |
| 51 | 1377 | University of Ryukyus / 琉球大学 | | 867 | 2032 | 1841 | 1687 |
| 52 | 1383 | Nagoya Institute of Technology / 名古屋工業大学 | | 2526 | 2349 | 1542 | 1526 |
| 53 | 1388 | Doshisha University / 同志社大学 | | 835 | 1369 | 2061 | 2022 |
| 54 | 1402 | University of Yamanashi / 山梨大学 | | 2273 | 2792 | 1661 | 1373 |
| 55 | 1428 | Tokyo Women's Medical University / 東京女子医科大学 | | 4373 | 2894 | 2550 | 1102 |
| 56 | 1452 | Fukuoka University / 福岡大学 | | 1787 | 2127 | 2645 | 1519 |
| 57 | 1459 | Saga University / 佐賀大学 | | 1634 | 2512 | 2463 | 1441 |
| 58 | 1459 | Kitasato University / 北里大学 | | 2702 | 2764 | 2655 | 1264 |
| 59 | 1459 | Toho University / 東邦大学 | | 3113 | 2099 | 3579 | 1286 |
| 60 | 1485 | Hosei University / 法政大学 | | 986 | 1462 | 2220 | 2164 |
| 61 | 1521 | Ehime University / 愛媛大学 | | 1530 | 4442 | 1381 | 1181 |
| 62 | 1551 | Shimane University / 島根大学 | | 1391 | 2741 | 2105 | 1643 |
| 63 | 1554 | Tottori University / 鳥取大学 | | 1319 | 2998 | 1788 | 1629 |
| 64 | 1559 | Nagoya City University / 名古屋市立大学 | | 3962 | 3374 | 1711 | 1421 |
| 65 | 1570 | Chuo University / 中央大学 | | 1850 | 1825 | 2227 | 2043 |
| 66 | 1604 | Jichi Medical School / 自治医科大学 | | 3381 | 4011 | 2427 | 1136 |
| 67 | 1615 | Kansai University / 関西大学 | | 1478 | 1860 | 2112 | 2193 |
| 68 | 1619 | Hirosaki University / 弘前大学 | | 2760 | 2617 | 2693 | 1613 |
| 69 | 1623 | Ochanomizu University / お茶の水女子大学 | | 2125 | 2857 | 3286 | 1424 |
| 70 | 1643 | Rikkyo University / 立教大学 | | 2019 | 2180 | 2676 | 1932 |
| 71 | 1649 | University of Aizu / 会津大学 | | 2928 | 2716 | 1761 | 1900 |
| 72 | 1651 | Nippon Medical School / 日本医科大学 | | 6363 | 3678 | 2259 | 1339 |
| 73 | 1662 | Teikyo University / 帝京大学 | | 4384 | 3407 | 3525 | 1204 |
| 74 | 1665 | Fujita Health University / 藤田保健衛生大学 | | 3557 | 3987 | 1853 | 1428 |
| 75 | 1675 | Kochi University / 高知大学 | | 3101 | 3062 | 2605 | 1590 |
| 76 | 1682 | University of Miyazaki / 宮崎大学 | | 2583 | 2888 | 2586 | 1717 |
| 77 | 1685 | Kagawa University / 香川大学 | | 1721 | 3064 | 3197 | 1546 |
| 78 | 1694 | Sophia University / 上智大学 | | 2201 | 1808 | 2346 | 2356 |
| 79 | 1711 | Kwansei Gakuin University / 関西学院大学 | | 1391 | 2419 | 2047 | 2235 |
| 80 | 1725 | Nagaoka University of Technology / 長岡技術科学大学 | | 2671 | 2165 | 2929 | 2054 |
| 81 | 1777 | Toyohashi University of Technology / 豊橋科学技術大学 | | 3476 | 2445 | 2559 | 2126 |
| 82 | 1798 | Showa University / 昭和大学 | | 5123 | 3859 | 3139 | 1436 |
| 83 | 1812 | Kyoto Prefectural University of Medicine / 京都府立医科大学 | | 4670 | 4652 | 3142 | 1218 |
| 84 | 1855 | Kyoto Institute of Technology / 京都工芸繊維大学 | | 2656 | 3247 | 2465 | 2015 |
| 85 | 1859 | Jikei University School of Medicine / 東京慈恵会医科大学 | | 4636 | 4401 | 3280 | 1344 |
| 86 | 1864 | Aoyama Gakuin University / 青山学院大学 | | 2795 | 2364 | 2600 | 2385 |
| 87 | 1884 | Ibaraki University / 茨城大学 | | 2818 | 3140 | 2264 | 2203 |
| 88 | 1892 | University of Fukui / 福井大学 | | 2742 | 3977 | 2296 | 1871 |
| 89 | 1927 | University of Hyogo (Himeji Institute of Technology) / 兵庫県立大学 | | 3020 | 4070 | 2005 | 1970 |
| 90 | 1934 | Hitotsubashi University / 一橋大学 | | 1414 | 1707 | 2188 | 3166 |
| 91 | 1956 | Shibaura Institute of Technology / 芝浦工業大学 | | 2389 | 3347 | 1790 | 2428 |
| 92 | 1957 | Chubu University / 中部大学 | | 3081 | 3525 | 2608 | 2093 |
| 93 | 2017 | Fukushima Medical University / 福島県立医科大学 | | 3282 | 4513 | 3538 | 1569 |
| 94 | 2030 | Kyoto Sangyo University / 京都産業大学 | | 2408 | 2526 | 3364 | 2473 |
| 95 | 2037 | Hamamatsu University School of Medicine / 浜松医科大学 | | 6801 | 4872 | 2114 | 1755 |
| 96 | 2057 | Akita University / 秋田大学 | | 3185 | 3300 | 3624 | 2060 |
| 97 | 2060 | Oita University / 大分大学 | | 3376 | 3633 | 3614 | 1945 |
| 98 | 2087 | Ryukoku University / 龍谷大学 | | 1364 | 2016 | 2798 | 3147 |
| 99 | 2115 | Iwate University / 岩手大学 | | 2511 | 2770 | 3883 | 2338 |
| 100 | 2205 | Kurume University / 久留米大学 | | 5193 | 4411 | 4506 | 1552 |
